Für die Speisepilzzucht kommen beispielsweise folgende Substrate in Frage:
Körnerbrut wird in der Regel benutzt, um andere Substrate zu beimpfen. Man kann bestimmte Pilzarten auch direkt auf der Körnerbrut zur Fruchtung bringen.
Ebenfalls recht gängig sind Impfdübel. Dies sind Dübel aus Laubholz welche mit Myzel durchwachsen bzw. überwachsen sind.
Das Substrat muss feucht sein, darf aber nicht nass sein.
Wichtig beim Impfvorgang ist, die Brut möglichst gleichmäßig im Substrat zu verteilen. Dadurch wird das Substrat vom Myzel besser durchwachsen.
Das beimpfen von Baumstämmen geschieht am Besten auf folgende Weise: nachdem man den Stamm ausreichend gewässert hat, bohrt man mit einer Bohrmaschine Löcher in den Holzstamm (max. bis zur Mitte), und zwar in einer Spiralform von oben nach unten. Anschließend werden die Löcher mit Brut befüllt und der Baumstamm eventuell mit Frischhaltefolie eingewickelt. Eine andere Methode ist die "Schnittimpfmethode".